En 1937, il fut appelé à Rome pour participer au gouvernement central de son Ordre. Il devait y résider jusqu’en 1955 et occuper des fonctions de haute responsabilité au service du Carmel. Ramené en France par la guerre, il travailla inlassablement, de 1939 à 1946, pour soutenir les monastères de carmélites, tout en guidant la jeune fondation de Notre-Dame de Vie.

   En 1947 paraissait à Rome un texte qui donnait à cette nouvelle forme de consécration dans l'Eglise un cadre juridique adapté. Les Instituts séculiers étaient nés. Cette même année, le P. Marie-Eugène rencontrait pour la première fois un groupe de jeunes gens qui, en 1963, allait constituer la branche masculine de l'Institut.
   Dès 1948 la communauté installée dans le sanctuaire de Notre-Dame de Vie, et qui comprenait alors la branche féminine dont Marie Pila avait été élue responsable générale, devenait un Institut séculier de droit diocésain. 

Marie Pila

   En 1962, présent dans trois continents, l'Institut Notre Dame de Vie en sa branche féminine fut déclaré de droit pontifical. Cette expérience d'expansion confirmait le P. Marie-Eugène dans la connaissance de sa mission et la foi en sa grâce.

   En décembre 1964, il présida l'Eucharistie au cours de laquelle plusieurs prêtres diocésains et quelques séminaristes prononcèrent leur premier engagement. J'ai de l'amour pour des milliers d'enfants constatait le fondateur.

   Ils expérimentaient ce que le P. Marie-Eugène écrit dans Je veux voir Dieu: Le charisme d'apostolat et le sacerdoce ont leur efficacité propre et assurent une grâce de fidélité. Mais il n'est pas exact qu'ils préservent des dangers du monde. (... ) Le charisme appelle une union au Christ correspondant à sa puissance. Le sacerdoce requiert pour son exercice parfait l'identification au Christ prêtre et victime. ( ). L'apôtre doit aller vers les sources de cette vie divine que sont les sacrements. ( ) Ami de Dieu, il a le devoir de se tenir habituellement auprès de l'Hôte intérieur qui diffuse cette charité en nos âmes. ( ) Plus que tout autre, l'apôtre a besoin du commerce habituel avec Dieu qu'est l'oraison et doit se plier aux conditions essentielles qu'elle exige.